La sol·licitud de registre d’una Iniciativa Ciutadana europea l’ha de presentar un comitè de ciutadans compost per almenys set ciutadans europeus que resideixin com a mínim a set Estats membres de la UE, independentment de la seva nacionalitat, i s’ha d’adreçar a Comissió Europea, la qual, en dos mesos, ha d’acceptar o rebutjar el seu registre.

Les organitzacions, entitats o partits polítics no poden presentar iniciatives ciutadanes, han de ser directament els ciutadans europeus. Sí que poden, però, promoure o donar suport a les iniciatives ciutadanes.

La decisió sobre el registre de la iniciativa obeeix a motius jurídics, per la qual cosa pot impugnar-se. En cas de rebuig, la Comissió informarà als organitzadors de les raons del rebuig i les possibles vies de recursos judicials i extrajudicials que hi hagi a la seva disposició.

Un cop registrada la iniciativa, el comitè disposarà de dotze mesos per recollir les declaracions de suport necessàries a un mínim de set Estats membres. El nombre mínim de signatures que s’haurà de superar a cadascun d’aquests set països s'obté multiplicant el nombre de diputats al Parlament Europeu de l’Estat membre en qüestió per 750. En total s’hauran d’aconseguir un milió de suports de ciutadans europeus.

Pot donar suport a una iniciativa ciutadana qualsevol persona en edat de votar a les eleccions al Parlament Europeu (18 anys a tots els Estats membres llevat d’Àustria, on es pot votar a partir dels 16 anys).

El nombre de declaracions de suport l’haurà de certificar les autoritats competents de cada Estat membre. Aleshores, la Comissió disposarà de tres mesos per avaluar la iniciativa i decidir com actuar. Per fer-ho, es reunirà amb els organitzadors perquè li expliquin més detalladament els assumptes que plantegin.

Els organitzadors també tindran l'oportunitat de presentar la iniciativa en una audiència pública al Parlament Europeu.

Seguidament, la Comissió adoptarà una Comunicació on explicarà les seves conclusions sobre la iniciativa, les accions que té intenció d'emprendre, si s’escau, i els motius pels quals tirarà endavant o no aquestes accions.